當前快報:中國水產(chǎn)科學研究院淡水中心在青蝦低氧應激研究領域取得重要進展
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日前,由淡水漁業(yè)研究中心傅洪拓研究員領銜的水科院淡水蝦蟹遺傳育種創(chuàng)新團隊在青蝦低氧應激研究領域取得重要進展,相關成果論文“Integrated metabolomics and Transcriptomic Analysis of Hepatopancreas in Different Living StatusMacrobrachium nipponensein Response to Hypoxia”發(fā)表于期刊《Antioxidants》(JCR二區(qū)TOP,IF=7.675)上。
青蝦耐低氧能力極差,在養(yǎng)殖以及運輸過程中極易因缺氧而導致死亡,因此,對青蝦耐低氧分子機制開展的研究對青蝦產(chǎn)業(yè)發(fā)展壯大的重要性不言而喻。針對上述問題,團隊以日本沼蝦為研究對象,結合缺氧時不同生理狀態(tài)(存活、瀕死和死亡)下日本沼蝦的肝胰腺代謝組和轉錄組進行比較分析,分別發(fā)現(xiàn)了108、86和48種差異表達代謝物(differentially expressed metabolites,DEM)。通過分析發(fā)現(xiàn)了32種共有DEM,通過對共有DEM的篩選和低氧應激相關基因聯(lián)合分析,鑒定出12個低氧應激相關基因。其中,GTP磷酸烯醇丙酮酸酯羧激酶(PEPCK)是唯一在轉錄組和代謝組中排名均靠前的差異表達基因,因此,它被認為在調(diào)控青蝦缺氧應答過程中發(fā)揮重要作用。該研究填補了缺氧轉錄組分析片面性的缺口,并從代謝物中反向推斷出幾個與缺氧相關的新基因。本研究有助于說明缺氧脅迫下日本沼蝦相關的分子過程。
該項研究得到了藍色糧倉重點研發(fā)計劃(2018YFD0901303)和水科院基本科研業(yè)務費項目(2020TD36)等項目的支持。淡水中心水產(chǎn)遺傳育種研究室博士研究生許蕾為第一作者、傅洪拓研究員為通訊作者。
全文網(wǎng)址:https://www.mdpi.com/journal/antioxidants。
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